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恢复土著鱼种群的同时，银鱼等外来物种的种群调控也势在必行。据介绍，要减少银鱼数量，必须进行人工捕捞。为避免捕捞银鱼时误捕其它鱼，如今银鱼专项捕捞换成了银鱼专用刺网，在夜晚进行灯光诱捕。同时科学测算资源量，根据生长繁殖规律确定开捕时间。
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据介绍，上世纪八九十年代，为了增加产量，阳宗海引入太湖新银鱼，没想到给土著鱼带来了灾难。银鱼数量多、繁殖快，部分土著鱼的鱼卵也成了银鱼的佳肴，而好不容易孵化出的土著鱼幼鱼与银鱼抢夺食物不占优势，生长受到影响；而过去采用拖网捕捞银鱼，不少土著鱼一同被打捞上岸，也是土著鱼种群数量锐减的原因之一。
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